Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psd3Q2PFD7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms