Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp1aQ2LKU9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp1aQ2LKU9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms