Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo3bQ1EG27 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms