Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam171bQ14CH0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam171bQ14CH0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms