Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Traf3ip1Q149C2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Traf3ip1Q149C2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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