Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Perm1Q149B8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Perm1Q149B8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Perm1Q149B8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Perm1Q149B8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Perm1Q149B8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Perm1Q149B8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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Perm1Q149B8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Perm1Q149B8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Perm1Q149B8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Perm1Q149B8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Perm1Q149B8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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