Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc162pQ0VG85 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms