Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2b3Q0VF55 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2b3Q0VF55 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms