Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmntd2Q0VET5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmntd2Q0VET5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms