Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms