Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab42Q0PD08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab42Q0PD08 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms