Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps8Q0P5W1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps8Q0P5W1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms