Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Neurl1bQ0MW30 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms