Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf541Q0GGX2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf541Q0GGX2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms