Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms