Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms