Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms