Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Col9a2Q07643 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms