Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cntn3Q07409 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms