Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms