Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp2Q06649 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms