Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPINDOCQ05AH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms