Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnal1Q05A62 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnal1Q05A62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms