Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SryQ05738 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SryQ05738 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SryQ05738 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SryQ05738 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SryQ05738 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SryQ05738 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SryQ05738 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SryQ05738 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SryQ05738 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SryQ05738 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SryQ05738 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SryQ05738 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms