Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc2Q05020 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc2Q05020 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms