Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox9Q04887 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms