Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RelaQ04207 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RelaQ04207 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RelaQ04207 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms