Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Crisp3Q03402 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Crisp3Q03402 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms