Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mark3Q03141 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mark3Q03141 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms