Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfiaQ02780 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfiaQ02780 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms