Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms