Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uba1Q02053 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms