Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RykQ01887 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RykQ01887 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RykQ01887 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RykQ01887 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RykQ01887 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RykQ01887 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RykQ01887 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RykQ01887 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms