Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd1Q01822 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd1Q01822 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms