Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme2Q01768 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms