Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms