Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms