Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sec23aQ01405 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms