Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga4Q00651 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Itga4Q00651 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms