Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms