Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GabpaQ00422 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabpaQ00422 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabpaQ00422 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms