Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb4P99026 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb4P99026 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms