Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc1P98083 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shc1P98083 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms