Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gfra1P97785 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gfra1P97785 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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