Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
rp9P97762 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
rp9P97762 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
rp9P97762 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
rp9P97762 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
rp9P97762 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
rp9P97762 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
rp9P97762 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
rp9P97762 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
rp9P97762 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
rp9P97762 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
rp9P97762 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
rp9P97762 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
rp9P97762 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
rp9P97762 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
rp9P97762 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
rp9P97762 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
rp9P97762 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
rp9P97762 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
rp9P97762 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
rp9P97762 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
rp9P97762 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms