Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkp1P97350 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkp1P97350 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms