Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms