Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HpcaP84075 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HpcaP84075 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HpcaP84075 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms