Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbx1P82976 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms