Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms